fa شناسایی بیوانفورماتیکی ژن NKAIN1 به عنوان یک بیومارکر بالقوه مرتبط با سرطان پستان و بررسی بیان آن با استفاده از تکنیک Real Time PCR علوم پزشکی / ايمونولوژي و بيولوژي Medical Sciences / Immunology and Biology پژوهشي Research <div> <table align="left" hspace="0" vspace="0"> <tbody> <tr> <td style="padding: 0cm 12px; text-align: justify;" valign="top"><span style="font-size:10pt"><span style="line-height:normal"><span style="text-autospace:none"><span style="direction:rtl"><span style="unicode-bidi:embed"><span new="" roman="" style="font-family:" times=""><b><span lang="AR-SA" style="font-size:12.0pt"><span b="" mitra="" style="font-family:">مقدمه و هدف: </span></span></b><span lang="AR-SA" style="font-size:12.0pt"><span b="" mitra="" style="font-family:">سرطان پستان شایع‌ترین سرطان تشخیص داده ‌شده و دومین علت مرگ ‌و میر ناشی از سرطان ها در زنان در سراسر جهان است.</span></span> <span lang="AR-SA" style="font-size:12.0pt"><span b="" mitra="" style="font-family:">در سال‌های اخیر، شناسایی بیومارکرهای بالقوه مرتبط با سرطان پستان و ترکیبات درمانی جدید منجر به پیشرفت‌های امیدوار کننده‌ای در درمان سرطان پستان شده است. هدف از مطالعه حاضر شناسایی بیومارکرهای بالقوه‌ی مرتبط با سرطان پستان است که با استفاده از دیتابیس‌ها و آنالیزهای بیوانفورماتیکی انجام می شود.</span></span><span lang="FA" style="font-size:12.0pt"><span style="font-family:"B Mitra""></span></span></span></span></span></span></span></span><br> <span style="font-size:10pt"><span style="line-height:normal"><span style="direction:rtl"><span style="unicode-bidi:embed"><span new="" roman="" style="font-family:" times=""><b><span lang="AR-SA" style="font-size:12.0pt"><span b="" mitra="" style="font-family:">روش کار:</span></span></b> <span lang="AR-SA" style="font-size:12.0pt"><span b="" mitra="" style="font-family:">در این مطالعه از یک روش</span></span><span lang="FA" style="font-size:12.0pt"><span b="" mitra="" style="font-family:">&shy;</span></span> In silico<span lang="AR-SA" style="font-size:12.0pt"><span b="" mitra="" style="font-family:"> برای شناسایی بیومارکرهای مرتبط با سرطان </span></span><span lang="FA" style="font-size:12.0pt"><span b="" mitra="" style="font-family:">پستان</span></span><span lang="AR-SA" style="font-size:12.0pt"><span b="" mitra="" style="font-family:"> بر اساس داده&shy;های ترانسکریپتوم استفاده شد.</span></span> <span lang="FA" style="font-size:12.0pt"><span b="" mitra="" style="font-family:">سپس از روش کمی </span></span><b>&nbsp;</b>Real Time PCR (qRT-PCR)<b> </b><span lang="FA" style="font-size:12.0pt"><span b="" mitra="" style="font-family:">برای تجزیه‌ و تحلیل بیان متفاوت بیومارکر شناسایی‌شده استفاده شد.</span></span><b><span lang="AR-SA" style="font-size:12.0pt"><span style="font-family:"B Mitra""></span></span></b></span></span></span></span></span><br> <span style="font-size:10pt"><span style="line-height:normal"><span style="direction:rtl"><span style="unicode-bidi:embed"><span new="" roman="" style="font-family:" times=""><b><span lang="AR-SA" style="font-size:12.0pt"><span b="" mitra="" style="font-family:">یافته&shy; ها:</span></span></b> <span lang="AR-SA" style="font-size:12.0pt"><span b="" mitra="" style="font-family:">تجزیه ‌و تحلیل با پایگاه‌های اطلاعاتی موجود مرتبط با سرطان، ارتباط بین افزایش بیان ژن </span></span>NKAIN1<span style="font-size:12.0pt"><span b="" mitra="" style="font-family:"> و سرطان پستان را نشان داد و تکنیک </span></span>qRT-PCR<span style="font-size:12.0pt"><span b="" mitra="" style="font-family:"> افزایش سطح بیان این ژن را در بافت‌های سرطان پستان در مقایسه با بافت‌های طبیعی تأیید نمود</span></span><span lang="FA" style="font-size:12.0pt"><span b="" mitra="" style="font-family:">.</span></span></span></span></span></span></span><br> <span style="font-size:10pt"><span style="line-height:normal"><span style="direction:rtl"><span style="unicode-bidi:embed"><span new="" roman="" style="font-family:" times=""><b><span lang="AR-SA" style="font-size:12.0pt"><span b="" mitra="" style="font-family:">نتیجه&shy; گیری:</span></span></b> <span lang="AR-SA" style="font-size:12.0pt"><span b="" mitra="" style="font-family:">با توجه به نتایج آنالیز </span></span>In<i> </i>silico<span style="font-size:12.0pt"><span b="" mitra="" style="font-family:"> و کمی سازی با </span></span>RT-PCR<span lang="AR-SA" style="font-size:12.0pt"><span b="" mitra="" style="font-family:">، ژن </span></span>NKAIN1<span lang="AR-SA" style="font-size:12.0pt"><span b="" mitra="" style="font-family:"> می‌تواند به</span></span> <span lang="AR-SA" style="font-size:12.0pt"><span b="" mitra="" style="font-family:">‌عنوان یک نشانگر زیستی بالقوه در تشخیص سرطان پستان در سطح </span></span>mRNA<span style="font-size:12.0pt"><span b="" mitra="" style="font-family:"> استفاده شود.</span></span><span lang="FA" style="font-size:12.0pt"><span style="font-family:"B Mitra""></span></span></span></span></span></span></span></td> </tr> </tbody> </table> </div> <div style="text-align: justify;"></div> <div> <table align="center" hspace="0" vspace="0"> <tbody> <tr> <td style="padding: 0cm 12px; text-align: justify;" valign="top"><span style="font-size:11pt"><span style="line-height:110%"><span style="unicode-bidi:embed"><span calibri="" style="font-family:"><b><span style="font-size:10.0pt"><span style="line-height:110%"><span new="" roman="" style="font-family:" times="">Introduction:</span></span></span></b><span style="font-size:10.0pt"><span style="line-height:110%"><span new="" roman="" style="font-family:" times=""> Breast cancer is the most commonly diagnosed cancer and the second leading cause of cancer related deaths in women worldwide. Therefore, cancer screening biomarker, for early detection and diagnosis, is urgently required for timely treatment and better cancer management.</span></span></span> <span style="font-size:10.0pt"><span style="line-height:110%"><span new="" roman="" style="font-family:" times="">The aim of this study was to identify potential biomarkers associated with breast cancer using databases and bioinformatics analyses.</span></span></span></span></span></span></span><br> <span style="font-size:11pt"><span style="text-justify:kashida"><span style="text-kashida:0%"><span style="line-height:110%"><span style="unicode-bidi:embed"><span calibri="" style="font-family:"><b><span style="font-size:10.0pt"><span style="line-height:110%"><span new="" roman="" style="font-family:" times="">Materials </span></span></span></b><b><span style="font-size:10.0pt"><span style="line-height:110%"><span new="" roman="" style="font-family:" times="">and Methods</span></span></span></b><b><span style="font-size:10.0pt"><span style="line-height:110%"><span new="" roman="" style="font-family:" times="">:</span></span></span></b> <span style="font-size:10.0pt"><span style="line-height:110%"><span new="" roman="" style="font-family:" times="">In this study, an in silico approach was used for the identification of breast cancer associated biomarkers based on transcriptome data. Then, quantitative Real Time PCR technique (qRT-PCR) was used for differential expression analysis of identified biomarker.</span></span></span></span></span></span></span></span></span><br> <span style="font-size:11pt"><span style="line-height:normal"><span style="unicode-bidi:embed"><span calibri="" style="font-family:"><b><span style="font-size:10.0pt"><span new="" roman="" style="font-family:" times="">Results:</span></span></b><span style="font-size:10.0pt"><span new="" roman="" style="font-family:" times=""> Analysis of available cancer related databases revealed an association between increased expression of NKAIN1 gene and breast cancer. &nbsp;Moreover, qRT-PCR technique confirmed the increased expression level of this gene in breast tumor tissues compared to normal tissues</span></span><b><span style="font-size:10.0pt"><span new="" roman="" style="font-family:" times="">.</span></span></b></span></span></span></span><br> <span style="font-size:11pt"><span style="line-height:normal"><span style="unicode-bidi:embed"><span calibri="" style="font-family:"><b><span style="font-size:10.0pt"><span new="" roman="" style="font-family:" times="">Conclusion:</span></span></b> <span style="font-size:10.0pt"><span new="" roman="" style="font-family:" times="">According to the results of in silico analysis and RT-PCR quantification, the NKAIN1 mRNA level can be used as a potential biomarker in the diagnosis of breast cancer.</span></span></span></span></span></span></td> </tr> </tbody> </table> </div> <div style="text-align: justify;"></div> سرطان پستان, NKAIN1, بیومارکر Breast cancer, NKAIN1, Biomarker 853 862 http://journal.jmu.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-587-1&slc_lang=fa&sid=1 Mohammad Ali-Hassanzadeh محمد علی حسن زاده 10031947532846006333 10031947532846006333 No Assistant Professor, Department of Immunology, School of Medicine, Jiroft University of Medical Sciences, Jiroft, Iran استادیار، گروه ایمنی شناسی، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی جیرفت، جیرفت، ایران Ali Golestan علی گلستان 10031947532846006334 10031947532846006334 No PhD Student in Medical Biotechnology, Institute of Cancer Research, Shiraz University of Medical Sciences, Shiraz, Iran / Shiraz Institute for Cancer Research, School of Medicine, Shiraz University of Medical Sciences, Shiraz, Iran دانشجوی زیست فناوری پزشکی، گروه زیست فناوری پزشکی، دانشکده علوم و فناوری‌های نوین پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی شیراز، شیراز، ایران/ مرکز تحقیقات سرطان شناسی شیراز، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی شیراز، شیراز، ایران Ahmad Tahmasebi احمد طهماسبی 10031947532846006335 10031947532846006335 No Institute of Biotechnology, Shiraz University of Medical Sciences, Shiraz, Iran پژوهشکده بیوتکنولوژی، دانشگاه شیراز، شیراز، ایران Amin Ramezani امین رمضانی : aramezani@sums.ac.ir 10031947532846006336 10031947532846006336 Yes Shiraz Institute for Cancer Research, School of Medicine, Shiraz University of Medical Sciences, Shiraz, Iran / Assistant Professor, Department of Medical Biotechnology, School of Advanced Medical Sciences and Technologies, Shiraz University of Medical Sciences, Shiraz, Iran مرکز تحقیقات سرطان شناسی شیراز، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی شیراز، شیراز، ایران / استادیار، گروه زیست فناوری پزشکی، دانشکده علوم و فناوری های نوین پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی شیراز، شیراز، ایران