fa شناسایی مایکوباکتریوم آویوم کمپلکس با استفاده از روش ترادف یابی چند جایگاهی علوم پزشکی / ميکرب شناسي Medical Sciences / Microbiology پژوهشي Research <p dir="RTL"><strong>مقدمه:</strong> مایکوباکتریوم آویوم کمپلکس به صورت گسترده در محیط وجود دارند و عامل ایجاد کننده بیماری در حیوانات، پرندگان و بیماران نقص سیستم ایمنی و افراد سالم می باشد. هدف از این مطالعه به کارگیری روش ترادف یابی چند جایگاهی <span dir="LTR">(MLSA)</span> در شناسایی مایکوباکتریوم آویوم کمپلکس بود.<br> <strong>روش کار:</strong> در این مطالعه، ابتدا توالی ژن های <span dir="LTR">16S rRNA</span>، <em><span dir="LTR">rpoB</span></em> و <em><span dir="LTR">hsp65</span></em> برای 8 زیر گونه از کمپلکس مایکوباکتریوم آویوم از بانک ژنی جمع آوری شد. سپس این توالی ها به وسیله نرم افزار <span dir="LTR">clustalW2</span> هم ردیف شدند و براساس این ژن ها درخت های فیلوژنتیکی رسم شد. در نهایت، توسط نرم افزار <span dir="LTR">CLC Main benchwork</span> توالی مربوط به هر زیر گونه با هم ترکیب شد و درخت فیلوژنتیک با روش <span dir="LTR">neighbor-joining</span> رسم شد.<br> &nbsp;</p> <p dir="RTL"><strong>یافته ها:</strong> نتایج مبنی بر روش <span dir="LTR">MLSA</span> بهتر از مطالعه جداگانه ژن های <span dir="LTR">16S rRNA</span>، <em><span dir="LTR">rpoB</span></em> و <em><span dir="LTR">hsp65</span></em> بود.</p> <p dir="RTL"><strong>نتیجه گیری:</strong> روش <span dir="LTR">MLSA</span> ابزاری مفید برای شناسایی و افتراق زیرگونه های مایکوباکتریوم آویوم کمپلکس است.</p> <strong>Introduction:</strong> <em>Mycobacterium avium </em>complex (MAC) are ubiquitous in the environment which are the cause of disease in animals, birds and patients with immunodeficiency and healthy individual. The purpose of this study was to apply the multi-location sequencing method (MLSA) to identify <em>mycobacterium </em><em>avium complex</em>.<br> <strong>Methods:</strong> In this study, the sequences of 16S rRNA, <em>rpoB</em> and <em>hsp65</em> genes were collected from the GenBank for 8 subtypes of <em>Mycobacterium avium complex</em>. Then these sequences were aligned using clustalW2 software, and based on these genes, phylogenetic trees were constructed. Finally, using CLC Main benchwork software combined the sequence for each sub-species, and the phylogenetic tree was constructed with a neighbor-joining technique.<br> <br> <strong>Results:</strong> The results of the MLSA method were better than the separate study of 16S rRNA, <em>rpoB</em>, and <em>hsp65</em> genes.<br> <br> <strong>Conclusion: </strong>The MLSA method is a useful tool for identifying and differentiating <em>Mycobacterium</em> <em>avium</em> complex subtypes.<br> &nbsp; مایکوباکتریوم آویوم, ترادف یابی چندجایگاهی, 16S rRNA, gyrB, hsp65 Mycobacterium avium, Multi-locus Sequence Analysis, 16S rRNA, rpoB, hsp65 86 94 http://journal.jmu.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-104-2&slc_lang=fa&sid=1 masoud keikha مسعود کیخا masoud.keykha90@gmail.com 10031947532846001073 10031947532846001073 Yes Isfahan Medical School دانشگاه علوم پزشکی اصفهان